En cuanto a las actividades ejecutivas, el Centro cuenta con una Dirección General encargada, además de representar legalmente a la institución, de dirigir sus actividades para ampliar constantemente la cobertura de intercambio y cooperación con instituciones nacionales y extranjeras de la misma índole, con el objetivo de consolidar su presencia en el ámbito académico.

En lo que concierne a las actividades administrativas, el Centro posee una Coordinación Administrativa, responsable de cumplir con todas las disposiciones que indican las instancias superiores que para tal efecto ha dispuesto el sistema de planeación democrática que impulsa el gobierno federal.

En lo que toca a sus actividades sustantivas, el Centro está organizado en una estructura funcional que comprende tres divisiones académicas o coordinaciones, las cuales son la base de sus actividades, y que son conducidas por una Secretaría Académica. 

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